Agresja faszystowska Niemiec na Polskę 1 września 1939 roku w brutalny sposób przerwała naukę szkolną. Okres okupacji zapisał tragiczną kartę w historii naszej szkoły. 28 lipca 1943 roku, po pacyfikacji Woli Justowskiej hitlerowcy zgromadzili pod murami szkoły okolicznych mieszkańców. Rozstrzelano wówczas 21 niewinnych ludzi.
28 października radny Pan Szczęsny Filipiak, Pani dyrektor Ewa Poznańska oraz uczniowie naszej szkoły uczcili pamięć rozstrzelanych mieszkańców Woli Justowskiej. Dzieci zapaliły także znicze pod tablicą pamiątkową na Cmentarzu Salwatorskim.
